לקראת חגיגות המאה להקמת ראשון-לציון, מושבה ראשונה לעלייה הראשונה, החל צוות הארכיון בעזרת ותיקי המושבה, לאסוף מסמכים, תצלומים, כלי בית וכלים חקלאיים ממקורות פרטיים. כל אלו העשירו את מאגר המידע ואפשרו את הקמת התצוגות ופתיחת המוזיאון, בשנת תשמ"ב, 1982.

מאגר המידע מורכב מאוספים רשמיים ותיעודיים, כולל: רשומות ואוספים אחרים – תצלומים, כרזות, מפות ותוכניות, סרטים וקלטות וידיאו, אוסף תיעוד בע"פ ואוסף חפצים.

על בסיס חומרי הארכיון הוקם "אלבום המשפחות הממוחשב" המתעד את "עדת ראשון-לציון" בארבעים שנותיה הראשונות. במשך כל השנים, מאז הקמת המוזיאון ועד היום הזה, ממשיכים צאצאי משפחות הוותיקים החיים בארץ ובחו"ל לתרום את אוספיהם למוזיאון.

המאגר משמש מרכז למידה ומחקר בנושא ראשון-לציון, העלייה הראשונה ותולדות היישוב בארץ-ישראל וכן מהווה בסיס לתצוגות המוזיאון ולתוכניות ההדרכה.

בארכיון מתקיימים ימי עיון, השתלמויות של גופים שונים וכן נערכות התמחויות מעשיות לארכיונאים ואנשי מוזיאולוגיה.